Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.13□□□□□ -2.231e-7■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-203ENST00000394776 2818 ntTSL 221.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 217.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 HIBADH-204ENST00000496814 570 ntTSL 323.58■■□□□ 1.374e-9■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 HIBADH-203ENST00000428288 1669 ntTSL 323.51■■□□□ 1.354e-9■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.234e-9■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-220ENST00000524210 2591 ntTSL 519.84■□□□□ 0.779e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 219.41■□□□□ 0.79e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-208ENST00000498199 511 ntTSL 217.26■□□□□ 0.359e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 312.41□□□□□ -0.429e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 35.57□□□□□ -1.529e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.42□□□□□ -1.79e-10■■■■■ 29.1
U2AF2P26368 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 29
U2AF2P26368 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 29
U2AF2P26368 AL157392.3-214ENST00000612284 794 ntTSL 56.78□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 29
U2AF2P26368 AQR-202ENST00000543879 5722 ntTSL 28.46□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 AQR-204ENST00000559090 3637 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATE1-206ENST00000481784 326 ntTSL 52.61□□□□□ -1.994e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 29
U2AF2P26368 ANKRD17-204ENST00000510127 504 ntTSL 23.88□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 29
U2AF2P26368 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.753e-10■■■■■ 29
U2AF2P26368 THOC2-217ENST00000492203 641 ntTSL 34.3□□□□□ -1.725e-11■■■■■ 29
U2AF2P26368 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 PLSCR4-208ENST00000476202 814 ntTSL 514.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 PLSCR4-209ENST00000481701 683 ntTSL 44.75□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-207ENST00000417017 684 ntTSL 518.43■□□□□ 0.541e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 517.94■□□□□ 0.461e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-210ENST00000444735 691 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.531e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 210.68□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 58.82□□□□□ -11e-9■■■■■ 29
U2AF2P26368 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 DIP2A-208ENST00000478105 3234 ntTSL 214.54□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 55.74□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 37.31□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 HNRNPK-203ENST00000376256 562 ntTSL 26.22□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 BMP2K-206ENST00000507670 1170 ntTSL 1 (best)3.28□□□□□ -1.887e-13■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 FECH-203ENST00000585494 1874 ntTSL 224.26■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 FECH-210ENST00000592699 1049 ntTSL 319.21■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 FECH-208ENST00000591977 544 ntTSL 55.56□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 CLPX-203ENST00000558958 1493 ntTSL 1 (best)20.77■□□□□ 0.927e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 CLPX-205ENST00000559218 533 ntTSL 49.4□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 KATNBL1-213ENST00000560310 597 ntTSL 46.52□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 KATNBL1-212ENST00000560308 725 ntTSL 35.51□□□□□ -1.537e-7■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 AC079062.1-202ENST00000581011 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 AC079062.1-201ENST00000584544 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-10■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 27.38□□□□□ -1.232e-10■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.77□□□□□ -1.332e-10■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 217.17■□□□□ 0.341e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 211.53□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 28.9
U2AF2P26368 WDR36-202ENST00000505303 2126 ntTSL 515.97■□□□□ 0.158e-10■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.448e-10■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.548e-10■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR36-204ENST00000513710 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.638e-10■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR36-201ENST00000504122 554 ntTSL 48.41□□□□□ -1.065e-14■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 57.4□□□□□ -1.226e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-218ENST00000522535 653 ntTSL 425.83■■□□□ 1.736e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.721e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM20A-203ENST00000590074 1642 ntTSL 224■■□□□ 1.431e-8■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 UBE2G2-203ENST00000462569 762 ntTSL 223.69■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PRR14L-206ENST00000461722 718 ntTSL 323.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TRAPPC12-220ENST00000482645 1538 ntTSL 222.65■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-216ENST00000569887 549 ntTSL 522.57■■□□□ 1.21e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NBPF1-205ENST00000449853 2755 ntTSL 1 (best)22.38■■□□□ 1.171e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 394.7 ms