Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA4P22748 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA4P22748 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA4P22748 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA4P22748 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA4P22748 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA4P22748 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA4P22748 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA4P22748 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA4P22748 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA4P22748 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA4P22748 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CA4P22748 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA4P22748 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA4P22748 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CA4P22748 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA4P22748 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms