Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRNPP04156 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRNPP04156 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRNPP04156 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRNPP04156 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRNPP04156 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms