Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCO2O43819 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCO2O43819 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCO2O43819 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCO2O43819 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCO2O43819 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCO2O43819 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCO2O43819 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCO2O43819 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCO2O43819 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCO2O43819 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCO2O43819 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCO2O43819 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCO2O43819 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCO2O43819 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCO2O43819 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms