Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCP110O43303 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCP110O43303 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCP110O43303 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCP110O43303 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCP110O43303 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCP110O43303 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCP110O43303 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCP110O43303 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCP110O43303 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCP110O43303 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCP110O43303 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCP110O43303 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms