Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN7Q9Y6W3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN7Q9Y6W3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1156.1 ms