Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms