Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHA12Q9UN75 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA12Q9UN75 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms