Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPCAL4Q9UM19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPCAL4Q9UM19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms