Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APPL1Q9UKG1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms