Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RBM42Q9BTD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms