Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX27Q96GQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX27Q96GQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX27Q96GQ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms