Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXPE3Q969Y0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXPE3Q969Y0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms