Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00301Q8NCQ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00301Q8NCQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms