Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC82Q8N4S0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC82Q8N4S0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms