Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC11Q7Z392 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms