Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEDD8Q15843 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD8Q15843 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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