Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1CQ15572 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1CQ15572 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1CQ15572 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1CQ15572 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1CQ15572 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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