Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
EEA1Q15075 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
EEA1Q15075 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
EEA1Q15075 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
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