Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RUNX2Q13950 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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