Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNAPC2Q13487 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAPC2Q13487 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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