Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GRIN2AQ12879 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GRIN2AQ12879 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GRIN2AQ12879 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
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