Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 CTK1YKL139W 1587 nt5.66□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 HUL4YJR036C 2679 nt5.66□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 YTM1YOR272W 1383 nt5.66□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 RCM1YNL022C 1473 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 MMT2YPL224C 1455 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 HIS4YCL030C 2400 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 ALG2YGL065C 1512 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 ART10YLR392C 1557 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 MCX1YBR227C 1563 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 NUS1YDL193W 1128 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 YDR056CYDR056C 618 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 GTT1YIR038C 705 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 YNR042WYNR042W 429 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 WRS1YOL097C 1299 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 TRS33YOR115C 807 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 YOR338WYOR338W 1092 nt5.65□□□□□ -1.5
SSF2Q12153 TRE1YPL176C 2352 nt5.65□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 TYW1YPL207W 2433 nt5.65□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 IOC4YMR044W 1428 nt5.65□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 NAM9YNL137C 1461 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 NUP116YMR047C 3342 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 HIR2YOR038C 2628 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ALD3YMR169C 1521 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ALD2YMR170C 1521 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 COQ4YDR204W 1008 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YEA4YEL004W 1029 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 TRX2YGR209C 315 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 PRS1YKL181W 1284 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ZPS1YOL154W 750 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 FEX1YOR390W 1128 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MET31YPL038W 534 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 FEX2YPL279C 1128 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RRP7YCL031C 894 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YKR015CYKR015C 1707 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 CDC9YDL164C 2268 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ENT1YDL161W 1365 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RKM2YDR198C 1440 nt5.64□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 SIF2YBR103W 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ARX1YDR101C 1782 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MAL11YGR289C 1851 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ATP16YDL004W 483 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MHF2YDL160C-A 243 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 NOP16YER002W 696 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 DCV1YFR012W 609 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 EST3YIL009C-A 546 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 FIP1YJR093C 984 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 IRC25YLR021W 540 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YMR130WYMR130W 909 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 BUD17YNR027W 954 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 snR44snR44 211 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 TFA1YKL028W 1449 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 HRR25YPL204W 1485 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 APM3YBR288C 1452 nt5.63□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MGS1YNL218W 1764 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ROT2YBR229C 2865 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 SKM1YOL113W 1968 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ELP2YGR200C 2367 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 SLC1YDL052C 912 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RPL35BYDL136W 363 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RAD55YDR076W 1221 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MEI4YER044C-A 1227 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 SPT15YER148W 723 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RSM27YGR215W 333 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 SMD2YLR275W 333 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YLR339CYLR339C 552 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YMR010WYMR010W 1218 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MDG1YNL173C 1101 nt5.62□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 VAC17YCL063W 1272 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 VMA7YGR020C 357 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 DOA1YKL213C 2148 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ECM9YKR004C 1134 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MIM2YLR099W-A 264 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 ECM15YBL001C 315 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 BUD22YMR014W 1560 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 POC4YPL144W 447 nt5.61□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MSC7YHR039C 1935 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YAP1802YGR241C 1707 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 CAX4YGR036C 720 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YJL218WYJL218W 591 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 IMP2YMR035W 534 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RPC34YNR003C 954 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 RFM1YOR279C 933 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 TYE7YOR344C 876 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YPL199CYPL199C 723 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 FRE1YLR214W 2061 nt5.6□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 EUG1YDR518W 1554 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 TDA11YHR159W 1515 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 MCH4YOL119C 1506 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YMR111CYMR111C 1389 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 UBA2YDR390C 1911 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 DET1YDR051C 1005 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 DBP8YHR169W 1296 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 YKL162CYKL162C 1209 nt5.59□□□□□ -1.51
SSF2Q12153 UAF30YOR295W 687 nt5.59□□□□□ -1.51
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