Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM33P57088 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM33P57088 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms