Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M2P53677 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms