Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A3P48751 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A3P48751 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A3P48751 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms