Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EFNA1P20827 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFNA1P20827 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms