Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGB3P05106 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB3P05106 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms