Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF3BA8MYP8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3BA8MYP8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms