Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLF12Q9Y4X4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF12Q9Y4X4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLF12Q9Y4X4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms