Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A6Q9P2U8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A6Q9P2U8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms