Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TVP23BQ9NYZ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TVP23BQ9NYZ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms