Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZCCHC17Q9NP64 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms