Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPIFA1Q9NP55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms