Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRA6Q9BX79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STRA6Q9BX79 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms