Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPRD1AQ96P16 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPRD1AQ96P16 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms