Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPNS2Q96L46 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPNS2Q96L46 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPNS2Q96L46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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