Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPTQ96BT3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPTQ96BT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms