Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSSK4Q6SA08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms