Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC23A3Q6PIS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms