Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf135Q5VTT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms