Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDKN3Q16667 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN3Q16667 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKN3Q16667 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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