Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SHROOM2Q13796 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SHROOM2Q13796 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
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