Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSTF3Q12996 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSTF3Q12996 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSTF3Q12996 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CSTF3Q12996 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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