Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTP4A2Q12974 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTP4A2Q12974 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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