Protein–RNA interactions for Protein: Q12269

TY1B-GR2, Transposon Ty1-GR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR2Q12269 RAD53YPL153C 2466 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 PAP1YKR002W 1707 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 PAN5YHR063C 1140 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 REC104YHR157W 549 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 IRC9YJL142C 393 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 NAT3YPR131C 588 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 ARR1YPR199C 885 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 SPT15YER148W 723 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 BUD27YFL023W 2391 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YGL108CYGL108C 423 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 UTP9YHR196W 1728 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 IRC18YJL037W 675 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 RSE1YML049C 4086 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YMR317WYMR317W 3423 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 TCB2YNL087W 3537 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 ECM32YER176W 3366 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YKL050CYKL050C 2769 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YGR053CYGR053C 852 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YLR156WYLR156W 345 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YLR159WYLR159W 345 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YLR161WYLR161W 345 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 snR42snR42 351 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 HAL5YJL165C 2568 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 AIM17YHL021C 1398 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 BUB1YGR188C 3066 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 NKP1YDR383C 717 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 SHO1YER118C 1104 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YOR387CYOR387C 621 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 UBP13YBL067C 2244 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 NOP4YPL043W 2058 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 CDC26YFR036W 375 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 ECM34YHL043W 513 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YIL054WYIL054W 318 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 RPL8BYLL045C 771 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 TMA10YLR327C 261 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 ATG11YPR049C 3537 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-GR2Q12269 BMH2YDR099W 822 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 YJL218WYJL218W 591 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 NRM1YNR009W 750 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MDM12YOL009C 816 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 PUS7YOR243C 2031 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 ELM1YKL048C 1923 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MRP13YGR084C 1020 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 PCA1YBR295W 3651 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 PHM8YER037W 966 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 RPL34AYER056C-A 366 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 APC11YDL008W 498 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 FAD1YDL045C 921 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 YPT7YML001W 627 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MOT2YER068W 1764 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 GOT1YMR292W 417 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 YNL320WYNL320W 855 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 TRP4YDR354W 1143 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 ORC1YML065W 2745 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MEC3YLR288C 1425 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 GAC1YOR178C 2382 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 UTP23YOR004W 765 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 YND1YER005W 1893 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 SMC3YJL074C 3693 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 KIC1YHR102W 3243 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 HAT2YEL056W 1206 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MED7YOL135C 669 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 MED4YOR174W 855 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 PBP2YBR233W 1242 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1B-GR2Q12269 VMA1YDL185W 3216 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 DNA2YHR164C 4569 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 GRX4YER174C 735 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 RHO3YIL118W 696 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 PRP40YKL012W 1752 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YHR202WYHR202W 1809 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YHL026CYHL026C 948 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YRA2YKL214C 612 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 URA7YBL039C 1740 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YGR125WYGR125W 3111 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 MRPL11YDL202W 750 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 PRE4YFR050C 801 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 PFK26YIL107C 2484 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 SRO7YPR032W 3102 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 SWP82YFL049W 1872 nt5□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 SET5YHR207C 1581 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 ECM22YLR228C 2445 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 ENA2YDR039C 3276 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 ENA1YDR040C 3276 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 STI1YOR027W 1770 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 ARO4YBR249C 1113 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 RPL30YGL030W 318 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 YJR020WYJR020W 333 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1B-GR2Q12269 PIR1YKL164C 1026 nt4.98□□□□□ -1.61
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