Protein–RNA interactions for Protein: Q06164

MMS22, E3 ubiquitin-protein ligase substrate receptor MMS22, yeastyeast

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MMS22Q06164 CBP3YPL215W 1008 nt5.35□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 RIM21YNL294C 1602 nt5.34□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 PEX7YDR142C 1128 nt5.34□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 YPT7YML001W 627 nt5.34□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 CDS1YBR029C 1374 nt5.34□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 MSB2YGR014W 3921 nt5.34□□□□□ -1.55
MMS22Q06164 FLO5YHR211W 3228 nt5.33□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 YCL075WYCL075W 441 nt5.33□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 YDR444WYDR444W 2064 nt5.33□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 OSH3YHR073W 2991 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 TRM1YDR120C 1713 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 AVT1YJR001W 1809 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 BMH1YER177W 804 nt5.32□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 YTM1YOR272W 1383 nt5.31□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 CDC14YFR028C 1656 nt5.31□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 YGL218WYGL218W 651 nt5.31□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 COA4YLR218C 453 nt5.31□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 MSR1YHR091C 1932 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 ERJ5YFR041C 888 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 POL3YDL102W 3294 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 TOS3YGL179C 1683 nt5.3□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 ATG2YNL242W 4779 nt5.29□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 SLI1YGR212W 1407 nt5.29□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 MTR4YJL050W 3222 nt5.29□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 HAL5YJL165C 2568 nt5.29□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 SLD2YKL108W 1362 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 RPS11AYDR025W 471 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 RPS8BYER102W 603 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 COX23YHR116W 456 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 RNH203YLR154C 333 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 RPS8AYBL072C 603 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 GRE1YPL223C 507 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 DRS2YAL026C 4068 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 IFM1YOL023W 2031 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 FAS2YPL231W 5664 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 YNL247WYNL247W 2304 nt5.28□□□□□ -1.56
MMS22Q06164 NKP1YDR383C 717 nt5.27□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 MCK1YNL307C 1128 nt5.27□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 YBR137WYBR137W 540 nt5.27□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 PPZ1YML016C 2079 nt5.27□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 PCA1YBR295W 3651 nt5.27□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 SHO1YER118C 1104 nt5.26□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 RAD53YPL153C 2466 nt5.26□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 EXO5YBR163W 1758 nt5.26□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 YGR107WYGR107W 450 nt5.26□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 NIS1YNL078W 1224 nt5.26□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 ESF1YDR365C 1887 nt5.25□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 ARC15YIL062C 465 nt5.25□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 MED4YOR174W 855 nt5.25□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 TAF8YML114C 1533 nt5.25□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 HOM3YER052C 1584 nt5.24□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 GCN5YGR252W 1320 nt5.24□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 AUR1YKL004W 1206 nt5.24□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 RPL15AYLR029C 615 nt5.24□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 MRPL16YBL038W 699 nt5.24□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 RAD26YJR035W 3258 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 ELM1YKL048C 1923 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 ASN1YPR145W 1719 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 TRS85YDR108W 2097 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 USB1YLR132C 873 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 OAF1YAL051W 3144 nt5.23□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 TAF7YMR227C 1773 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 MRH1YDR033W 963 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 YGL074CYGL074C 327 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 PPX1YHR201C 1194 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 MDM1YML104C 3384 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 RRN11YML043C 1524 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 IME4YGL192W 1803 nt5.22□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 PAM1YDR251W 2493 nt5.21□□□□□ -1.57
MMS22Q06164 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 HGH1YGR187C 1185 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 PNG1YPL096W 1092 nt5.21□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 TRP4YDR354W 1143 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 DBP3YGL078C 1572 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 SET5YHR207C 1581 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 TIF4632YGL049C 2745 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 PRP40YKL012W 1752 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 COS8YHL048W 1146 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 YJR085CYJR085C 318 nt5.2□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 ZDS1YMR273C 2748 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 HCA4YJL033W 2313 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 ECM22YLR228C 2445 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 GSC2YGR032W 5688 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 EMW1YNL313C 2715 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 YJL175WYJL175W 513 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 YOR022CYOR022C 2148 nt5.19□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 MET10YFR030W 3108 nt5.18□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 THR4YCR053W 1545 nt5.18□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 RAD1YPL022W 3303 nt5.18□□□□□ -1.58
MMS22Q06164 MYO5YMR109W 3660 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.1 ms