Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC63Q05C16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC63Q05C16 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms