Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SIK1P57059 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIK1P57059 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIK1P57059 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIK1P57059 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIK1P57059 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIK1P57059 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIK1P57059 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIK1P57059 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SIK1P57059 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SIK1P57059 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIK1P57059 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SIK1P57059 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms