Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M2P53677 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M2P53677 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms